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Puces à Protéines

16/07/12

La plateforme IMPACT propose un ensemble de techniques de Puces à Protéines pouvant répondre à diverses problématiques scientifiques. Elle propose son expertise dans l'utilisation de puces commerciales, mais également dans la conception de puces à façon. Le principe de cette technologie, ainsi que quelques exemples sont présentées ci-dessous.

 

Principe

 

Puces à antigènes (peptides ou protéines purifiées)


Outil dans le domaine Biomédical

 

Exemples de domaines d'applications:

Diagnostic de Maladies Infectieuses,

Autoimmunes, Allergie...

 

Arnaud mc & al. Proteomics. 2004

Blinder et al.. 2006 Auimmunity reviews

Gaudin JC, Clin Exp Allergy. 2008

 

 

Puces à protéines totales (RPPA)

Permet pour suivre l'évolution de quelques marqueurs dans un nombre important d'échantillons

 

 

Exemples de domaines d'applications:

Validation de l'action de molécules thérapeutiques,

Suivi de cinétiques d'activation

 

 

Dépôts d'extraits protéiques totaux (cellules, tissus...)

Spécificité importante des anticorps (validation)

Faible consommation de matériel biologique

 

 

Dupuy & al, Proteomics. 2009

 

 

Puces à Anticorps

 

 

Adapté à la comparaison des niveaux d'expression d'un grand nombre de protéines cible

Recherche de Biomarqueurs & Profiling Protéique

 

Utilisation des puces commerciales large spectre ou orientées/dédiées vers certaines cibles:

phospho-MAPK, cytokines, Angiogenèse, Phospho-RTK,obésité...

 

« Dye Swap » = Marquage des protéines deux couleurs

Yeretsian et al. 2005 Molecular and Cellular Proteomics

 

System Sandwich

Feron et al., 2009. Am J Pathol.

 

 

La conception d'une puce à anticorps sur la plateforme impose l'utilisation d'anticorps hautement spécifique